Одним з найбільших портових міст є Одеса. Вона є одним з найбільших портових міст України. У зв‘язку з збільшенням об‘ємів морських перевезень в середині 70-х років ХХ ст. Були створені два міста супутника Одеси: Південний та Іллічевськ. У Іллічівську функціонують рибний та торгівельний порти, базується Чорноморське об‘єднання рибної промисловості “Антарктика” рибопереробний завод та судноремонтний завод. У Южному розташований Одеський припортовий завод – кінцевий пункт аміакопроводу з м. Тольятті Самарської області.
Портовий вузол Іллічівськ –Одеса -Південний, який простягнувся по морському узбережжю на 60 км, складає дуже напружену обстановку для морської екосистеми цього району.
В портах приймаються заходи по запобіганню скиду з суден забруднених вод та бруду. Всі тверді та рідкі відходи, що накопичуються на суднах під час рейсів, здаються у портах в спеціальні берегові очисні споруди. Забруднення морського середовища відбувається в результаті скиду у море не до чищених стічних вод прибережних міст.
Потенційно небезпечним в екологічному відношенні є Одеський припортовий завод у порту Південний.
Севастопіль – база Військово-морського флоту України. Інфраструктура міста в основному придатна для обслуговування військово-морського флоту. Діють суднобудівні та судоремонтні підприємства, приладобудівний завод підприємства по переробці риби та сільгосппродукції.