Об’єктами контролю Інспекції є:
1) морські порти та портові пункти України на Чорному морі, у відкритих лиманах, на річках Дніпро та Дунай, судноремонтні підприємства, майстерні, причали та приморські об’єкти рибного господарства в повному обсязі їх впливу на навколишнє природне середовище;
2) усі об’єкти (в тому числі Міноборони, Держкомкордону, СБУ, МВС), підприємства, установи та організації (незалежно від форм власності та підпорядкування), їхня господарська діяльність, яка може чинити негативний вплив на морське середовище і, зокрема, полягає в скиданні стічних вод у морські води або лимани, що мають зв’язок з морем;
3) усі українські та іноземні судна, кораблі та інші плавучі об’єкти і морські споруди незалежно від форм власності та підпорядкування, діяльність яких відбувається у внутрішніх морських водах, територіальному морі, виключній (морській) економічній зоні України та на континентальному шельфі України.
Інспекцію очолює начальник, який одночасно за посадою є
Головним державним інспектором з охорони навколишнього природного
середовища Чорного моря. Начальник Інспекції призначається на посаду Міністром екології та природних ресурсів України за поданням Головного державного інспектора України з охорони навколишнього природного середовища. Начальник Інспекції має двох заступників, які за посадою є одночасно заступниками Головного державного інспектора з охорони навколишнього природного середовища Чорного моря. Заступники начальника Інспекції призначаються на посаду Міністром екології та природних ресурсів України за поданням начальника Інспекції. Начальники відділів, дільниць, секторів є за посадою одночасно старшими державними інспекторами, а головні, провідні спеціалісти і спеціалісти - державними інспекторами з охорона навколишнього природного середовища Чорного моря.
