Державна інспекція охорони Чорного моря (далі – Інспекція) є територіальним органом Міністерства екології та природних ресурсів України і входить до сфери його управління. У процесі виконання своїх повноважень Інспекція взаємодіє з місцевими органами виконавчої влади, органами місцевого самоврядування, територіальними органами контролю рибних ресурсів Міністерства аграрної політики України, спеціально уповноваженим органом виконавчої влади у сфері екології та природних ресурсів в Автономній Республіці Крим, Державною інспекцією охорони Азовського моря, державними управліннями екології та природних ресурсів в Одеській, Миколаївській та Херсонській областях Мінекоресурсів України, правоохоронними органами, митними і прикордонними службами та громадськими організаціями.
Основні завдання та функції держекоінспекції Чорного моря є аналогічними держекоінспекції Азовського моря.
Діяльність Інспекції поширюється на:
1) внутрішні морські води, територіальне море, континентальний шельф України, виключну (морську) економічну зону України та на лимани, які мають зв’язок з морем (Дніпровсько-Бузький, Дністровський, Григорівський, Сухий);
2) прибережну смугу суші, ширина якої встановлюється відповідно до протоколів розмежування функцій із спеціально уповноваженим органом виконавчої влади у сфері екології та природних ресурсів в Автономній Республіці Крим, державними управліннями екології та природних ресурсів в Одеській, Миколаївській та Херсонській областях (контроль у частині забруднення та іншого негативного впливу на морське середовище в результаті господарської діяльності об’єктів, які в ній розташовані).