Отруйний для більшості гідробіонтів. Утворюється при мікробіальному розкладі органічних речовин. Частка метану , що утворюється у водоймах надходить в атмосферу, частина окислюється бактеріями до вугільної кислоти. Особливо багато метану виділяють ґрунти ставків і озер з високим вмістом органічних сполук.