Основними джерелами забруднення вод є: стічні води промислових та комунальних підприємств; добрива, отрутохімікати, що змиваються талими і дощовими водами з сільськогосподарських угідь; стічні води тваринницьких комплексів; теплі скидні води ТЕС та АЕС; мінералізовані шахтні, рудничні та кар’єрні води; стічні води рекреаційних зон; атмосферні опади; звалища сміття, цвинтарі тощо.
Речовини, котрі викликають погіршення якості води, називаються забруднюючими. Поряд з фізичними та хімічними забруднювачами, має місце теплове, біологічне та побутове забруднення води.