Солі важких металів, особливо зі змінною валентністю, знешкоджуються у процесі життєдіяльності ряду водоростей та бактерій. Так, важкі метали повністю зникають з води через 30 днів після дії водоростей Scenedesmus quadricauda та Chlorella vulgaris.
Свідченням закінчення самоочищення водойм є відмирання мікроорганізмів і припинення споживання кисню для окислення органічних речовин.
Здатність до самоочищення має свої межі. За умови зростаючого антропогенного навантаження водойми вже не здатні самотужки його подолати.
